В аспирантуру кафедры экологии и географии растений поступают выпускники как российских, так и зарубежных вузов для повышения своей квалификации. Традиционно набор в аспирантуру происходит под новые и действующие научные проекты кафедры, финансируемые ведущими научными фондами.